Dapprima distinti, i due ospedali furono progressivamente accorpati dal 1973, con il trasferimento di vari reparti dal Morgagni al Pierantoni a causa dell'insufficiente capacità della sede centrale. L'unificazione definitiva avvenne nel 2004, con il trasferimento di tutte le attività nella nuova struttura a Vecchiazzano, mantenendo il nome "Morgagni - Pierantoni". 

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